花生DGAT基因家族的生物信息学分析

2018年第06期

关键词:
花生 二酰甘油酰基转移酶(DGAT) 进化 表达模式

Keywords
Peanut;Diacylglycerol acyltransferase(DGAT);Evolution;Expression pattern
下载地址:    全文下载
摘要
     含油量是花生最重要的品质性状之一。花生油的主要成分是三酰甘油(TAG),二酰甘油酰基转移酶(DGAT)是催化合成TAG的关键酶类,其活性高低与含油量呈正相关。本研究利用生物信息学方法对花生DGAT(Ah DGAT)基因家族的进化、基因结构特点、表达模式以及可变剪接等进行了分析。进化分析结果显示,Ah DGAT1、Ah DGAT2和Ah DGAT3亲缘关系较近,与Ah WSD/DGAT的亲缘关系稍远。Ah DGAT1具有17~18个外显子,Ah DGAT2具有7~9个外显子,Ah DGAT3具有2~3个外显子,而Ah WSD/DGAT具有3~6个外显子。Ah DGAT1的跨膜区数目为7~11个,Ah DGAT2和Ah WSD/DGAT为0~2个,Ah DGAT3没有跨膜结构。另外,4个亚家族均具有自己特有的保守结构域和表达模式。Ah DGAT1和Ah DGAT2在种子中表达量较高,而Ah DGAT3和Ah WSD/DGAT在根和叶中的表达量较高。Ah DGAT1的可变剪接形式最多,其次为Ah WSD/DGAT。花生的4个Ah DGAT亚家族具有不同的特点,表明它们可能在进化中具有不同的祖先。


本文地址:www.fabiao.net/content-18-1848814-1.html

上一篇:花生FAD基因家族的全基因组鉴定与表达模式分析
下一篇:花生FAT基因家族的全基因组分析

分享到: 分享花生DGAT基因家族的生物信息学分析到腾讯微博           收藏
评论排行